? 碳—碳鍵形成是有機分子的構成基礎,也是化學及其他相關領域的核心科學問題,新型聚酮合酶的發(fā)現(xiàn)可為未來開發(fā)碳—碳合成工具提供全新思路。近日,中國科學院院士、武漢大學藥學院教授鄧子新團隊在聚酮生物合成領域取得新進展,相關成果在線發(fā)表于《德國應用化學》。
聚酮化合物作為天然產(chǎn)物六大類型中的一個重要類型,包含了上萬個活性天然產(chǎn)物,是新藥發(fā)現(xiàn)的重要源泉。盡管數(shù)量龐大且結構紛繁復雜,但聚酮的生物合成方式非常保守,均由聚酮合酶通過催化縮合簡單的小分子砌塊形成。
據(jù)了解,根據(jù)聚酮合酶的結構以及碳—碳鍵的合成方式不同,聚酮合酶可分為3種類型。其中,I型聚酮合酶為含有多個結構域的大分子量酶,其碳—碳鍵的形成主要由酮基合成酶結構域(KS domain)以線性方式催化合成;II型聚酮合酶是由多個獨立的單功能酶組成的酶系,其碳—碳鍵的形成主要由一類特殊的酮基合成酶異源二聚體(KSα-KSβ)通過迭代縮合方式合成;III型聚酮合酶,則是由一個同源二聚的酮基合成酶(KS)構成,以迭代縮合方式合成簡單的黃酮類化合物。
Asukamycin是結節(jié)鏈霉菌產(chǎn)生的一類聚酮化合物,結構上含有兩個末端基團不同的反式三烯上下鏈。研究人員通過解析上鏈的形成機制,發(fā)現(xiàn)一類新的聚酮合酶。雖然該聚酮合酶與II型聚酮合酶類似,也是由多個游離的酶組成,但二者存在本質上的不同。該新型聚酮合酶利用了一對特殊的KAS III同源蛋白(AsuC3、AsuC4)作為碳—碳鍵合成工具,催化合成了聚酮碳鏈。
通常情況下KAS III只負責II型聚酮以及脂肪酸生物合成的起始階段。該研究發(fā)現(xiàn)AsuC3、AsuC4既具有起始功能,又具有催化碳—碳鍵延伸的能力。通過與酮還原酶(AsuC7)、脫水酶(AsuC8/C9)配合,AsuC3、AsuC4可以獨立地以迭代循環(huán)的方式形成聚烯長鏈。此外,AsuC3、AsuC4還具有極其寬泛的底物譜,能夠識別最短2個碳、最長11個碳的各類環(huán)狀、支鏈、直鏈飽和及不飽和的?;鵆oA底物,展現(xiàn)了強大的碳—碳鍵合成能力。最后,基因組分析發(fā)現(xiàn),此類聚酮合酶還存在于許多微生物基因組中,暗示著這一發(fā)現(xiàn)具有廣譜性。